生態旅游經濟的發展固然重要，與此同時，在開發的過程中也要注意保護景物的原始形態。即使我國的旅游資源十分豐富，旅游景區的開發也要遵循相應的原則以保護原始的自然環境。不僅如此，景區的開發方案也要因地制宜，不同的地理條件以及地勢特點是景區開發需要考慮的必要因素，將當地的獨特之處與相關的旅游項目相結合會為旅游經濟帶來相當大的推動力。除此之外，對于生態旅游的景區開發也要與大多數游客的需求相匹配，因為游客是帶動旅游行業經濟發展的關鍵因素，所以，旅游公司也要在最大程度上滿足游客對于景區景點的心理需求，這樣才能夠帶動旅游生態經濟進一步發展。
同時，合理開發生態旅游也必須要按照一定的科學方法和規律，不能為了開發生態旅游而破壞生態環境，應當遵循以下原則：
1、保護自然生態環境原則
旅游業的開發建設離不開自然生態資源，要想不斷更新發展旅游產品，必定會涉及自然生態旅游資源。在旅游開發建設上，一方面要對環境進行保護，另一方面要需要對資源環境進行開采整合，這本身就是相互矛盾的。但是，我們在開發旅游資源上應當做出合理規劃，對自然資源及人文資源做出相應的保護，有的資源是可再生的，比如植被，有的資源卻是不可再生的，比如巖石洞穴、世界物質文化遺產，一旦遭到破壞就不能恢復原貌。所以，在進行旅游產品開發、資源開采時，一定要以保護自然生態環境為首要原則。
2、可持續發展利用原則
在建設生態旅游景區時，應當考慮到是否可持續發展利用資源。保護生態環境是前提，可持續發展利用是目的。旅游公司應當有義務做好環境保護方面的宣傳，通過設計旅游產品，讓人們參與到保護大自然環境當中，在游客享受到大自然賦予的能量時，有意識地去保護資源。
